文件1
rs12345 G C
rs78901 A T
文件2
3 22745180 rs12345 G C,G
12 67182999 rs78901 A G,T
所需输出
3 22745180 rs12345 G C
12 67182999 rs78901 A T
我试了
awk 'NR==FNR {h[$1] = $3; next} {print $1,$2,$3,h[$2]}' file1 file2
生成的输出
3 22745180 rs12345
将文件2的前4列和文件1的第3列打印为输出中的第5列
您可以使用awk
:
awk 'FNR == NR {map[$1,$2] = $3; next} ($3,$4) in map {$NF = map[$3,$4]} 1' f1 f2 | column -t
3 22745180 rs12345 G C
12 67182999 rs78901 A T
可读性更强的版本:
awk '
FNR == NR {
map[$1,$2] = $3
next
}
($3,$4) in map {
$NF = map[$3,$4]
}
1' file1 file2 | column -t
仅用于表格输出的column -t
。